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Los sensores de flujo de calor se encuentran entre las herramientas de medición más robustas en la investigación agrometeorológica. Si bien estos sensores desempeñan un papel vital, obtener mediciones precisas del flujo de calor del suelo sigue siendo muy difícil. La constante variación de las propiedades térmicas, el flujo de agua y el deficiente contacto entre el sensor y el suelo generan problemas constantes. Los investigadores suelen colocar dos o tres sensores de flujo de calor del suelo a unos 4 cm por debajo.